Performance evaluation of the HepB

Performance evaluation of the HepB Typer-Entecavir kit for detection of entecavir resistance mutations in chronic hepatitis B
Sang Hoon Ahn,1,2,3,* Ji-Yong Chun,4,* Soo-Kyung Shin,4 Jun Yong Park,1,2 Wangdon Yoo,4 Sun Pyo Hong,4 Soo-Ok Kim,4 and Kwang-Hyub Han1,2,3
1Department of Internal Medicine, Institute of Gastroenterology, Yonsei University College of Medicine, Seoul, Korea.
2Liver Cirrhosis Clinical Research Center, Seoul, Korea.
3Brain Korea 21 Project for Medical Science, Seoul, Korea.
4Research and Development Center, GeneMatrix Inc., Seongnam, Korea.

Corresponding author: Soo-Ok Kim. Research and Development Center, GeneMatrix Inc., KOREA BIO PARK, 700 Daewangpangyo-ro, Bundang-gu, Seongnam 463-400, Korea. Tel. [phone], Fax. [phone], Email: [e-mail]
*These authors made an equal contribution to this work.

Received September 25, 2013; Revised October 31, 2013; Accepted November 07, 2013.

This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.


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Abstract

Background/Aims
Molecular diagnostic methods have enabled the rapid diagnosis of drug-resistant mutations in hepatitis B virus (HBV) and have reduced both unnecessary therapeutic interventions and medical costs. In this study we evaluated the analytical and clinical performances of the HepB Typer-Entecavir kit (GeneMatrix, Korea) in detecting entecavir-resistance-associated mutations.

Methods
The HepB Typer-Entecavir kit was evaluated for its limit of detection, interference, cross-reactivity, and precision using HBV reference standards made by diluting high-titer viral stocks in HBV-negative human serum. The performance of the HepB Typer-Entecavir kit for detecting mutations related to entecavir resistance was compared with direct sequencing for 396 clinical samples from 108 patients.

Results
Using the reference standards, the detection limit of the HepB Typer-Entecavir kit was found to be as low as 500 copies/mL. No cross-reactivity was observed, and elevated levels of various interfering substances did not adversely affect its analytical performance. The precision test conducted by repetitive analysis of 2,400 replicates with reference standards at various concentrations showed 99.9% agreement (2398/2400). The overall concordance rate between the HepB Typer-Entecavir kit and direct sequencing assays in 396 clinical samples was 99.5%.

Conclusions
The HepB Typer-Entecavir kit showed high reliability and precision, and comparable sensitivity and specificity for detecting mutant virus populations in reference and clinical samples in comparison with direct sequencing. Therefore, this assay would be clinically useful in the diagnosis of entecavir-resistance-associated mutations in chronic hepatitis B.

결과 (한국어) 1:

만성 B 형 간염에서에서 entecavir 저항 변이의 탐지를 위한 HepB 수 Entecavir 키트의 성능 평가
상 안 훈, 1, 2, 3, * 지 Yong 천, 4, * 수경 신, 4 Jun Yong 공원, 1, 2 Wangdon 유, 4 태양 표 Hong, 4 그래서 옥 4 김 고 광 협 Han1, 2, 3
1Department 내과, 위장과 연구소, 연 세 대학 의과대학, 서울, 한국.
2Liver 경 변 증 임상 연구 센터, 서울, 한국.
3Brain 한국 21 프로젝트 의학, 서울, 한국.
4Research 및 개발 센터, GeneMatrix Inc., 성남시, 한국.

해당 저자: 그래서 옥 김. 연구 및 개발 센터, GeneMatrix 주식 회사, 한국 바이오 파크, 700 Daewangpangyo로, 성남시, 성남 463-400, 한국. 전화입니다. 82-31-628-2088, 팩스. 82-31-628-2001, 이메일: [e-mail]
*이 저자에이 작품. 동등한 기여를 했다

받은 2013 년 9 월 25 일; 개정 2013 년 10 월 31 일; 2013 년 11 월 7 일을 허용 합니다.

이것은 크리에이티브 커먼즈 저작자 비-상업 라이센스 (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/) 무제한 비 상업적 사용, 배포, 허가의 조건에 따라 배포는 오픈 액세스 문서 오리지널 작품을 제공 하는 모든 매체에서의 복제는 제대로 인용 하 고.


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추상

배경/목표
분자 진단 방법을 B 형 간염 바이러스 (HBV)에 약물 내성 돌연변이의 신속한 진단을 가능 하 게 하 고 불필요 한 치료 내정간섭 및 의료 비용 감소. 이 연구에서 우리가 탐지 entecavir 저항 관련 돌연변이. HepB 수 Entecavir 키트 (GeneMatrix, 한국)의 분석 및 임상 성과 평가

방법
HepB 수-Entecavir 키트 탐지, 간섭, 분, 그것의 한계에 대 한 평가 고 정밀도 높은 titer HBV 부정적인 인간 혈 청에서 바이러스 성 주식 희석에 의해 HBV 참조 표준을 사용 하 여. Entecavir 저항 관련 돌연변이 검출을 위한 HepB 수 Entecavir 키트의 성능에서 108 환자. 396 임상 샘플에 대 한 직접 시퀀싱과 비교 되었다

결과
참조 표준을 사용 하 여 HepB 수 Entecavir 키트의 검출 한계는 500ml 복사본으로 낮은 것으로 발견 되었다. 없는 분, 관찰 하 고 다양 한 간섭 물질의 높은 수준 악영향을 미치지 않았다 분석 성능. 2400의 반복적인 분석에 의해 실시 하는 정밀 테스트를 99.9% 계약을 했다 하는 다양 한 농도에서 참조 표준 복제 (2398/2400). HepB 수 Entecavir 키트 및 396 임상 견본에서 직접 시퀀싱 분석 실험 사이 전반적인 일치 율은 높은 신뢰성 및 정밀도와 유사한 민감도 특이성 참조와 직접 시퀀싱에 비해 임상 견본에서 돌연변이 바이러스 인구를 탐지 하기 위한 보였다 99.5%.

Conclusions
The HepB 수 Entecavir 키트. 따라서, 이 분석 결과 것 entecavir 저항 관련 돌연변이의 진단에 유용한 임상적으로 만성 b 형 간염.

결과 (한국어) 2:

만성 B 형 간염에서 엔테카비어 내성 돌연변이의 검출을위한 HepB 타이 퍼 - 엔테카비어 키트의 성능 평가
훈 안, 1,2,3 상, * 지용 천, 4, * 한혜진 - 경 신, 6월 4일 용인 공원, 하나, 이 Wangdon 유, 4 일 표정훈 홍콩, 4 SOO-OK 김, 4, 광-Hyub Han1,2,3
내과의 1Department, 소화기 연구소, 의과. 연세대 학교 의과 대학
2Liver 간경변증 임상 연구 센터, . 서울
. 의료 과학, 서울, 한국 3Brain 한국 21 프로젝트
. 4Research 개발 센터, GeneMatrix 주식, 성남, 한국 SOO-OK 김 : 교신 저자. 연구 개발 (R & D) 센터, GeneMatrix 주식, KOREA BIO PARK, 700 Daewangpangyo 특별시, 성남시 분당구 463-400, 한국. 전화. + 82-31-628-2088 팩스. + 82-31-628-2001, 이메일 : [e-mail]는 . *이 저자는이 작품에 동일한 기여했다 2013년 9월 25일를 수신하는 단계; 2013년 10월 31일 개정; 2013년 11월 7일 받아 들였다. 이 제한 비상업적 사용을 허용 크리에이티브 커먼즈 저작자 표시 비영리 라이센스 (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/)의 규정에 따라 배포되는 오픈 액세스 문서입니다 한, 어떠한 정보 매체에 배포, 재생산, 원작이 제대로 인용 제공. 로 이동 추상 배경 ​​/ 목적 분자 진단 방법은 B 형 간염 바이러스 (HBV)의 약제 내성 돌연변이의 빠른 진단을 활성화 한 감소를 모두 치료 필요가있다 개입 및 의료 비용. 이 연구에서 우리는 엔테카비어 내성 관련 돌연변이를 검출 할 HepB 타이 퍼 - 엔테카비어 키트의 분석과 임상 성과 (GeneMatrix, 한국)를 평가 하였다. 방법 HepB 타이 퍼 - 엔테카비어 키트 교차 감지, 간섭의 한계에 대한 평가 HBV 음성 인간 혈청에서 고역가 바이러스 보유 희석하여 만든 HBV 참조 표준을 사용하여 반응성, 정밀. 저항 엔테카비어 관련된 돌연변이를 검출하기위한 HepB TYPER-엔테카비어 키트의 성능은 108 명의 환자에서 396 임상 샘플에 대한 직접 염기 서열과 비교 하였다. 결과 표준품을 사용하여, HepB TYPER-엔테카비어 키트의 검출 한계는 같은 것으로 밝혀졌다 저렴한 500 복사 / mL로. 어떠한 교차 반응은 관찰되지 및 악영향 분석 성능에 영향을 미치지 않았다 다양한 간섭 물질의 수준을 증가시켰다. 다양한 농도의 참조 표준은 99.9 %의 계약 (2,400분의 2,398)를 보여와 2400의 반복적 인 분석을 실시한 정밀 테스트를 복제합니다. 396 임상 샘플에서 HepB 타이 퍼 - 엔테 카비르 키트 및 직접 염기 서열 분석 사이의 전체 일치율은 99.5 %였다. 결론 HepB 타이 퍼 - 엔테카비어 키트는 레퍼런스 및 임상에서 돌연변이 바이러스 인구를 검출하는 높은 신뢰성과 정밀도와 비교 민감도와 특이도를 보였다 직접 염기 서열과 비교하여 샘플. 따라서, 이러한 분석은 만성 B 형 간염에서 엔테카비어 내성 관련 돌연변이의 임상 진단에 유용 할 것이다

결과 (한국어) 3:

성능 평가의 hepb typer-entecavir 키트에 대한 감지 저항 돌연변이 entecavir의 만성 B형 간염에서 상훈
Ahn,1,2,3,* ji-yong Chun,4,* 김수경 Shin,4 Jun Yong Park,1,2 wangdon Yoo,4 Sun 이영표 Hong,4 soo-ok Kim,4 및 kwang-hyub Han1,2,3
1Department 의대 삼성서울병원 소화기내과, 연구소의 연세대 의대, 서울, 한국.
2Liver 간경변증 등 임상 연구 센터, 서울, 의료 과학 Korea.
3Brain 21 한국 프로젝트, 서울, Korea.
4Research 및 개발 센터, genematrix Inc., 한국 성남.

해당 작성자: soo-ok 김. 연구 및 개발 센터, genematrix Inc., 한국bio, 700 박 daewangpangyo-ro, 성남시 분당구, 성남시, 463-400 한국. 전화: 82-31-628-2088, 팩스. 82-31-628-2001 , E-mail:
* [e-mail] 이러한 제작자가 이 작업을 기여 made.

25일 2013Received; 31일, 인정 2013Revised; 07 2013년 11월.

크리에이티브 커먼즈의 조건에 따라 배포 Open Access 문서(무제한 비상업적인 용도로 사용할 수 있는 속성 http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/) 비상업용 라이센스, 배포,및 생식에 모든 매체 제공하는 원본 작업이 올바르게 인용


가.:
추상

배경/ 목표
분자 진단 방법 사용 빠른 진단 약품에 내성 돌연변이에 B형 간염 바이러스 ( hbv) 및 축소할 수 있는 불필요한 치료 개입 및 의료 비용.이 연구는 분석 및 평가 임상 공연은 hepb typer-entecavir 키트( genematrix, 한국) entecavir- 저항 감지 관련 돌연변이 방법

.
는 hepb typer-entecavir 키트 평가의 한계에 대한 탐지, 간섭, 교차 반응성,및 정밀도 높은 주식 hbv 바이러스 titer 음 인간의 혈청에서 hbv 이전투구가 표준을 참조. entecavir 저항과 관련된 변이 감지하는 hepb typer-entecavir 키트의 성능 396 108 환자의 임상 샘플.

참조를 사용하여
결과 표준에 대한 직접 시퀀스에 비해,hepb typer-entecavir는 키트의 감지 한계로 낮은 500ml/본 것으로 드러났습니다. No Cross- 반응성 관찰했고 다양한 방해 물질의 높은은 부정적인 분석 성능에 영향을 주지 않습니다. 참조 표준 2,400 복제의 반복 분석에 의해 다양한 농도로 실시하는 정밀도 테스트 99.9% (2398/2400 보였다.) 계약어우러지는 전체 빈도 간의 hepb typer-entecavir 키트 및 직접 시퀀스 분석법 396 임상 샘플에서 99.5%이었 .


는 hepb 결론 typer-entecavir 키트 보여주었다 높은 신뢰성 및 정밀성, 동급 민감도와 특이도를 검색 돌연변이 바이러스 집단에서 참조 및 임상 샘플에서 비교를 통해 직접 시퀀스. 따라서,이 파마 임상적으로 유용한 entecavir- 저항 관련 변이의 진단에서 만성 B형 간염에서
것